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課程培訓(xùn)
GaussView 分子建模與計(jì)算結(jié)果可視化培訓(xùn)課程

GaussView 分子建模與計(jì)算結(jié)果可視化培訓(xùn)課程

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  • 培訓(xùn)對(duì)象:計(jì)算化學(xué)用戶、分子建模人員、需要快速構(gòu)建分子模型并可視化Gaussian計(jì)算結(jié)果的科研工作者。

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  • 培訓(xùn)目標(biāo)

    1. 掌握GaussView的分子構(gòu)建工具,能夠快速搭建有機(jī)分子、配合物、過(guò)渡態(tài)等復(fù)雜結(jié)構(gòu)。

    2. 熟練運(yùn)用GaussView設(shè)置Gaussian計(jì)算任務(wù),提交作業(yè)并監(jiān)控運(yùn)行狀態(tài)。

    3. 掌握GaussView的可視化功能,分析分子軌道、靜電勢(shì)、振動(dòng)模式與光譜數(shù)據(jù)。

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  • 培訓(xùn)內(nèi)容介紹

    1. GaussView界面導(dǎo)航:熟悉GaussView的主窗口、工具面板、分子列表與顯示設(shè)置,掌握基本視圖操作。

    2. 分子構(gòu)建基礎(chǔ):使用元素工具、鍵工具、環(huán)工具從零開(kāi)始構(gòu)建有機(jī)分子,調(diào)整鍵長(zhǎng)、鍵角與二面角。

    3. 高級(jí)建模技巧:構(gòu)建過(guò)渡金屬配合物,設(shè)置配位鍵;從晶體數(shù)據(jù)導(dǎo)入結(jié)構(gòu);構(gòu)建周期性結(jié)構(gòu)片段。

    4. 對(duì)稱性設(shè)置:檢測(cè)并設(shè)置分子點(diǎn)群,利用對(duì)稱性簡(jiǎn)化計(jì)算任務(wù)。

    5. Gaussian輸入文件生成:在GaussView中設(shè)置計(jì)算任務(wù)類型、方法、基組與附加關(guān)鍵詞,生成輸入文件。

    6. 作業(yè)提交與監(jiān)控:直接提交計(jì)算作業(yè)到本地或遠(yuǎn)程隊(duì)列,監(jiān)控作業(yè)狀態(tài),查看輸出文件。

    7. 結(jié)果導(dǎo)入與瀏覽:導(dǎo)入Gaussian輸出文件(.log、.chk),瀏覽優(yōu)化后的結(jié)構(gòu)、能量與頻率信息。

    8. 分子軌道可視化:加載格式化檢查點(diǎn)文件(.fchk),繪制HOMO、LUMO等分子軌道,設(shè)置等值面顯示參數(shù)。

    9. 靜電勢(shì)表面:生成分子靜電勢(shì)表面,映射靜電勢(shì)值到范德華表面,分析親電/親核位點(diǎn)。

    10. 振動(dòng)模式動(dòng)畫:可視化分子振動(dòng)模式,制作振動(dòng)動(dòng)畫,識(shí)別特征振動(dòng)(伸縮、彎曲、扭轉(zhuǎn))。

    11. 光譜模擬:從頻率計(jì)算結(jié)果生成紅外光譜與拉曼光譜圖,調(diào)整峰形與半峰寬。

    12. 圖像與動(dòng)畫輸出:導(dǎo)出高質(zhì)量圖像用于論文發(fā)表,制作分子振動(dòng)或反應(yīng)路徑動(dòng)畫用于演示。





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