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課程培訓(xùn)
計算化學(xué)數(shù)據(jù)處理與OriginPro繪圖綜合培訓(xùn)課程

計算化學(xué)數(shù)據(jù)處理與OriginPro繪圖綜合培訓(xùn)課程

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  • 培訓(xùn)對象:計算化學(xué)領(lǐng)域的研究人員,需要系統(tǒng)掌握從計算原始數(shù)據(jù)提取到專業(yè)圖表繪制的全流程技能。

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  • 培訓(xùn)目標(biāo)

    1. 掌握從Gaussian、VASP、GROMACS等計算軟件中提取有效數(shù)據(jù)的方法,建立標(biāo)準(zhǔn)化數(shù)據(jù)處理流程。

    2. 熟練運用OriginPro繪制計算化學(xué)領(lǐng)域的各類專業(yè)圖表(能帶、態(tài)密度、反應(yīng)能壘、RMSD、光譜)。

    3. 掌握數(shù)據(jù)統(tǒng)計分析與圖形定制技術(shù),生成可直接用于論文發(fā)表的出版級圖表。

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  • 培訓(xùn)內(nèi)容介紹

    1. 計算化學(xué)數(shù)據(jù)概述:了解不同計算軟件(Gaussian、VASP、QE、GROMACS)的輸出數(shù)據(jù)類型與格式特點。

    2. Gaussian數(shù)據(jù)提取:從Gaussian輸出文件提取能量、頻率、熱力學(xué)數(shù)據(jù)、優(yōu)化結(jié)構(gòu),使用GaussView或腳本批量處理。

    3. VASP數(shù)據(jù)提取:從OUTCAR、DOSCAR、EIGENVAL提取能量、力、態(tài)密度、能帶數(shù)據(jù),使用VASPKIT或Python腳本自動化處理。

    4. GROMACS數(shù)據(jù)分析:使用gmx工具提取RMSD、RMSF、回旋半徑、氫鍵數(shù)量、距離數(shù)據(jù),導(dǎo)出為文本格式。

    5. OriginPro數(shù)據(jù)導(dǎo)入:將提取的數(shù)據(jù)導(dǎo)入OriginPro,設(shè)置列屬性(X/Y/Z軸),建立多組數(shù)據(jù)的組織結(jié)構(gòu)。

    6. 能帶與態(tài)密度圖繪制:組合能帶數(shù)據(jù)與態(tài)密度數(shù)據(jù),創(chuàng)建能帶-態(tài)密度組合圖,設(shè)置費米能級參考線。

    7. 反應(yīng)能壘圖繪制:從NEB或IRC計算提取反應(yīng)坐標(biāo)與能量,繪制反應(yīng)路徑剖面圖,標(biāo)注過渡態(tài)與中間體。

    8. 光譜圖繪制:繪制紅外、拉曼、紫外-可見吸收光譜,設(shè)置峰形與半峰寬,添加標(biāo)注。





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